Ο ΟΑΕΕ έχει συνάψει συμβάσεις με τα ιδιωτικά καρδιοχειρουργικά κέντρα των Αθηνών (Υγεία, Ιατρικό κέντρο, Κεντρική Κλινική Αθηνών, Ωνάσειο, Ευρωκλινική Αθηνών, Κλινική Ψυχικού, Ευρωθεραπεία, Ιασώ General Metropolitan) και Θεσ/νίκης, (Γενική Κλινική, Άγιος Λουκάς, Ιατρικό Διαβαλκανικό. Κυανούς Σταυρός) , για τη διενέργεια καρδιοχειρουργικών επεμβάσεων και καλύπτει τα νοσήλια ύψους 8.804, 11 €.
Με βάση την αριθμ.6778/93 Υπουργική απόφαση υπεγράφη & ισχύει από 1/1/99 σύμβαση με το καρδιοχειρουργικό Κέντρο «Ωνάσειο». για τη διενέργεια μεταμοσχεύσεων καρδιάς – πνευμόνων σε ασθενείς ασφ/νους μας.